Η επιτυχής διαχείριση ενός πολυδιάστατου θέματος, όπως η υγεία και η ασφάλεια στην εργασία (ΥΑΕ), απαιτεί την ανάπτυξη στοχευμένων συνεργασιών.
Το ΕΛΙΝΥΑΕ, στην διάρκεια της λειτουργίας του, ανέπτυξε συνεργασίες τόσο με κορυφαίους εξειδικευμένους ακαδημαϊκούς φορείς της χώρας όσο και με κορυφαίους φορείς της ΥΑΕ ευρωπαϊκών χωρών, αλλά και με φορείς σχετιζόμενους με την επιχειρηματικότητα.
Επίσης, συμμετείχε σε εθνικές επιτροπές για καίρια θέματα σχετικά με την ΥΑΕ και δημιούργησε εξειδικευμένα τοπικά δίκτυα ειδικών ΥΑΕ για την ανταλλαγή απόψεων, εμπειριών και γνώσεων.